Убедитесь, что чтение данных заключено в цикл!
Тебе здесь еще не нужен numy:
while True:
with open("output.dat", "w") as f:
f.write("%.5f, %.5f, %.5f" % tuple(accelerometer_g_forces()))
Обратите внимание, что нет условий для прекращения вывода данных.