Я предполагаю, что любая интеграция с Java будет расширением поставщика. Какой компилятор вы используете?
Если ваша программа Cobol работает как пакетное задание, вы можете разделить его на два пакетных задания: одно, которое записывает все запросы для земли Java в файл, и другое, которое использует ответы из земли Java. Запустите между ними Java-программу, которая читает файл запросов и записывает файл ответов.