Я обнаружил, что мне нужно войти, отсоединить и затем заново связать их. Я думаю, что это было связано с разрешениями на эти ссылки или файлы, на которые они ссылались.
cd /opt/bitnami/apache2/conf
sudo rm server.crt
sudo ln -s /etc/letsencrypt/live/*filename*/fullchain.pem server.crt
То же самое с privkey.pem / server.key, а затем имена этих файлов изменились с красного на синий, я перезапустил сервер, используя приведенный ниже скрипт, и все было хорошо!
sudo /opt/bitnami/ctlscript.sh start
Где я нашел ответ: https://community.bitnami.com/t/chown-cannot-dereference-opt-bitnami-apache2-conf-server-crt-no-such-file-or-directory/58839/12