Почему spark не может прочитать большой текстовый файл JSON, несмотря на то, что памяти достаточно для выполнения и кеширования? - PullRequest
Новая
       35

Почему spark не может прочитать большой текстовый файл JSON, несмотря на то, что памяти достаточно для выполнения и кеширования?

0 голосов
/ 08 июня 2019

Я настроил автономный кластер (узел 32 ГБ и 32 ядра) с 2 рабочими по 16 ядер и 10 ГБ памяти каждый.Размер файла JSON составляет всего 6 ГБ.Я пытался настроить различные конфигурации, в том числе увеличение памяти молодого поколения.Есть ли что-то еще, что я пропускаю?

PS: Это не работает даже в spark-shell.

Конфигурации в файле env.

  • SPARK_EXECUTOR_MEMORY = 8g
  • SPARK_WORKER_CORES = 16
  • SPARK_WORKER_INSTANCES = 2
  • SPARK_WORKER_MEMORY = 101 * * * * 105 * 105 *пробовал следующие параметры конфигурации при отправке задания: 
    ./spark-submit --driver-memory 4g \
               --supervise --verbose \
               --conf spark.serializer=org.apache.spark.serializer.KryoSerializer \ 
               --conf spark.memory.fraction=0.2 \
               --conf spark.memory.storageFraction=0.5 \
               --conf spark.network.timeout=10000000 \
               --conf spark.executor.heartbeatInterval=10000000 

    val dataFrame = spark.read.option("multiline", "true")
                          .schema(schema)
                          .json(jsonFilePath)
                          .persist(StorageLevel.MEMORY_ONLY_SER_2)

dataFrame.createOrReplaceTempView("node")

val df = spark.sqlContext.sql("select col1, col2.x, col3 from node")
                         .persist(StorageLevel.MEMORY_ONLY_SER_2)

val newrdd = df.repartition(64)
               .rdd.mapPartitions(partition => {
                val newPartition = partition.map(x => {
                    //somefunction()
                }).toList
                newPartition.iterator
            }).persist(StorageLevel.MEMORY_ONLY_SER_2)

    Ошибка: 

         Lost task 0.0 in stage 0.0 (TID 0, 131.123.39.101, executor 0): java.lang.OutOfMemoryError: GC overhead limit exceeded

    Заранее спасибо

...