У меня есть проект bookdown, где некоторые ссылки корректно обрабатываются для pdf, но не для html.Например, эта разметка:
Авторы и разработчики моделей успешно использовали эту платформу для получения моделей, которые выиграли соревнования Kaggle [@ Raimondi2010], были реализованы в диагностических инструментах [@ jahani2016comparison, @ luo2016automatics],используются в качестве основы инвестиционных алгоритмов [@ stankovic2015investment] и используются в качестве инструмента скрининга для оценки безопасности новых фармацевтических продуктов [@ thomson2011not].
производит это в формате html
Авторы и разработчики моделей успешно использовали эту платформу для получения моделей, которые выиграли соревнования Kaggle (Raimondi 2010), были реализованы в диагностических инструментах (Jahani and Mahdavi 2016, @ luo2016automatics) , используются в качестве основы инвестиционных алгоритмов (Станкович, Маркович и Стоянович, 2015) и используются в качестве инструмента скрининга для оценки безопасности новых фармацевтических продуктов (Thomson et al. 2011).
и этоs в pdf
Авторы и разработчики моделей успешно использовали эту платформу для получения моделей, которые выиграли соревнования Kaggle (Раймонди, 2010), были реализованы в диагностических инструментах (Джахани и Махдави, 2016, Luo (2016)) , используются в качестве основы инвестиционных алгоритмов (Stanković et al., 2015) и используются в качестве инструмента скрининга для оценки безопасности новых фармацевтических продуктов (Thomson et al., 2011).
Здесь можно найти , и моя система использует:
## R version 3.6.0 (2019-04-26)
## Platform: x86_64-apple-darwin15.6.0 (64-bit)
## Running under: macOS High Sierra 10.13.6
##
## Locale: en_US.UTF-8 / en_US.UTF-8 / en_US.UTF-8 / C / en_US.UTF-8 / en_US.UTF-8
##
## Package version:
## base64enc_0.1.3 bookdown_0.11.1 digest_0.6.19 evaluate_0.14
## glue_1.3.1 graphics_3.6.0 grDevices_3.6.0 highr_0.8
## htmltools_0.3.6 jsonlite_1.6 knitr_1.23 magrittr_1.5
## markdown_1.0 methods_3.6.0 mime_0.7 Rcpp_1.0.1
## rmarkdown_1.13 stats_3.6.0 stringi_1.4.3 stringr_1.4.0
## tinytex_0.13 tools_3.6.0 utils_3.6.0 xfun_0.7
## yaml_2.2.0
> rmarkdown::pandoc_version()
[1] ‘2.0.5’
(edit - версия pandoc)