В Linux использование файлов с учетом регистра , поэтому используйте точные буквы (как sampleThreadGroup.jmx)
Также убедитесь, что файл сохранен в правильной папке
И убедитесь, что у вашего пользователя есть разрешение на его выполнение (попробуйте chmod 777
для файла jmx)