В настоящее время я занимаюсь исследованиями в университете и хотел создать собственный код, который мог бы анализировать количество изображений нейронов в часах и определять, включены ли нейроны или нет.Я хочу написать код сам, и мне было просто интересно, с чего мне начать.Например, какие вещи я могу импортировать в python для чтения света в TIFF-файлах и какие вещи мне нужно импортировать, чтобы извлечь эти данные в таблицу или график?
Некоторые пояснения: нейронывсегда в одном и том же месте на всех изображениях.Это черно-белое изображение.Изображения представляют собой часы активности нейронов, где изображение снимается каждую секунду или около того.Я не хочу, чтобы кто-то писал весь код для меня, но, пожалуйста, скажите, пожалуйста, какие вещи необходимы для чтения света в файлах TIFF и экспорта этих данных в какую-то таблицу или график.
Спасибо!
Мне не разрешено показывать фотографию в качестве примера, но я могу описать, как она выглядит.Фон весь черный.На изображениях разбросаны белые точки.Некоторые из них являются нейронами, и я могу определить, где они находятся.На всех фотографиях расположение нейронов одинаковое, некоторые нейроны подсвечены, а другие темные.Какие нейроны горят, а какие - темные, меняются с фото на фото.
У меня еще нет готового кода, так как я здесь ищу место для запуска в этом проекте.
Ожидаемый вывод кода, который смотрит на нейроны и видит, какие из нихЗагораются данные в виде таблицы, графика или даже текстового файла, если таблица или график невозможны.Таблица будет содержать либо 1, либо 0, 1, что означает, что нейрон светится, и 0, что означает, что нейрон темный.Для графика это будет иметь число, представляющее нейрон (1, 2, 3 4, ...) по оси Y и по оси X будет 1 или 0. Каждый столбец будет одно изображение, и выувидит, как активность каждого нейрона со временем изменится.Я открыт для любой другой формы данных.