Вы хотели бы перейти с 2.6 сегодня.
Почему? Потому что нет поддержки библиотеки для 3.1. Мы только что закончили портировать setuptools (под названием Distribute) на Python 3, так что, надеюсь, поддержка библиотек для Python 3 значительно возрастет в течение следующего года, но этого еще нет.
И не так сложно переключиться. Это не совсем новый язык, как это делают некоторые критики Python. Так что если вы начнете с Python 3, это тоже не беда. Просто сейчас будет непросто быть продуктивным в Python 3. Так что иди с 2.6.