Звучит как проблема с позиционированием (дух :)). Как выглядит код?
Где расположены кнопки на странице? Я думаю, чтобы это было правильно, кнопки должны иметь положение: абсолютное или положение: относительное, и их родительский элемент, который должен быть элементом div с папками или каким-либо другим элементом div внутри этого элемента (который прокручивается), также должен иметь положение: относительное, чтобы кнопки знали, за каким дивом следовать.
Видя, что фон кнопок повторяет прокрутку, первое, что нужно попробовать, это установить ее в положение: относительное.
Надеюсь, я кое-что прояснил, немного поторопившись, но, надеюсь, это даст вам представление о том, что искать.