Если два репозитория полностью независимы (т.е. не имеют общей истории), то копирование трех файлов из одного в другой не вызовет никакой синхронизации:
Если один из этих файлов изменится в repoA, он не изменится в репозитории B.
Лучшее, что вы могли бы сделать, - это сценарий и автоматизировать копирование из A в B, а в этом же сценарии добавить, зафиксировать и передать из repoB.