Perl-код для расчета наилучшего соответствия и RMSD между двумя наборами парных 3D-точек - PullRequest
0 голосов
/ 26 мая 2019

У меня есть два набора парных точек в трехмерном пространстве (например, 10 точек в объекте A, 10 точек в объекте B, точки являются парными - a1-b1, a2-b2, ..., a10-b10). Что мне нужно, это рассчитать значение RMSD наилучшего соответствия между этими парами точек. И мне это нужно в Perl. Это похоже на широко используемую процедуру; Однако я не смог найти готовый код Perl. Пожалуйста, предложите модуль Perl, который выполняет 3D-расчет наилучшего соответствия.

Биоинформационные методы общего назначения не совсем то, что я хочу, так как они работают с полноразмерными структурами и соответствующими аминокислотными остатками, а мне нужны только парные точки (представленные их координатами). Я также нашел реализацию Python, но я хочу Perl.

...