Как создать тепловую карту выражения с различными категориями в R? - PullRequest
0 голосов
/ 16 апреля 2019

Я создал тепловую карту в R, но у меня все еще возникают трудности с маркировкой образцов на две разные группы (Контроль против Обработки) на тепловой карте с включенным ключом.

Пока это код R:

data = read.csv("../Data/test3.csv", header = TRUE,row.names = 1)
data
mat=data.matrix(data, rownames.force = NA)
heatmap(mat, main = "Treatment vs Control ", xlab = "Samples", ylab = "DEG")

Тепловая карта https://i.ibb.co/r4VJkMR/heatmap.png

Аннотированный набор данных https://i.ibb.co/5MH2LgN/data.png

Как можно различать группы образцов на тепловой карте и предоставить ключ, пожалуйста,?

Обратите внимание, что я очень новичок в этом, поэтому, если вы можете предоставить примеры кода, это было бы очень полезно.

Я бы хотел, чтобы окончательная тепловая карта выглядела так, пожалуйста

Желаемый результат: https://i.ibb.co/4FdGnwz/1555438568827-793023657.png

Большое спасибо,

Ishack

...