Конечно. Файл ACLS - это, вероятно, тот путь, если у вас есть доступ к серверу.
Вы можете настроить каталог с именем Site1 и ACL Изменить права для локальной группы "LG-Site1" с соответствующими пользователями, а также каталог Site2 с правами изменения для группы "LG-Site2".
Вы заявляете, что хотите видеть только свой сайт, а не другой сайт - проблема в том, что если вы входите на сервер, у вас, вероятно, есть права администратора или, по крайней мере, права до того момента, когда все, что вы делаете, чтобы заблокировать себя из каталога Site2, может быть отменено - либо временно предоставив свои права, либо добавив себя в LG-Site2. Не обязательно шоу-стоппер, но, безусловно, соображение.
Вы также можете настроить FTP так, чтобы каждая команда разработчиков могла публиковать в своем каталоге, но не получать доступ к другому.