Панды - количество минут в разных диапазонах даты и времени - PullRequest
3 голосов
/ 06 июля 2019

Я ищу эффективный способ обработки следующих данных в пандах.

У меня есть фрейм данных, содержащий несколько сотен тысяч начальных и конечных временных отметок:

data_df
                      start_ts                     end_ts
0    2019-06-10 12:00:00+00:00  2019-06-10 22:30:00+00:00
1    2019-06-11 12:00:00+00:00  2019-06-11 13:30:00+00:00
2    2019-06-11 14:00:00+00:00  2019-06-11 19:00:00+00:00
3    2019-06-14 12:00:00+00:00  2019-06-14 18:30:00+00:00
4    2019-06-10 12:00:00+00:00  2019-06-10 21:30:00+00:00
5    2019-06-11 12:00:00+00:00  2019-06-11 18:30:00+00:00
...

У меня также естьнабор помеченных временных бинов (tp1 - tp10).Существует 10 лотков каждый день, но время этих лотков может меняться в зависимости от дня (например, tp1 может быть с 00:00 до 01:30 в один день, а затем с 00:00 до 01:45 в другой).день).Каждый обрабатываемый набор данных имеет 7 дней, по 10 временных периодов в день, поэтому набор диапазонов имеет размер 70 и выглядит следующим образом:

labeled_bins_df
                   start_range                  end_range  label
0    2019-06-10 00:00:00+00:00  2019-06-10 04:30:00+00:00    tp1
1    2019-06-10 04:30:00+00:00  2019-06-10 09:45:00+00:00    tp2
2    2019-06-10 09:45:00+00:00  2019-06-10 12:30:00+00:00    tp3
...

Мне нужна таблица с оригиналомdata_df данных, но с дополнительными столбцами, от tp1 до tp10, с количеством минут в каждой строке:

timed_bins
                      start_ts                     end_ts    tp1    tp2    tp3    tp4 ...
0    2019-06-10 12:00:00+00:00  2019-06-10 22:30:00+00:00      0      0     30    120 ...
1    2019-06-11 12:00:00+00:00  2019-06-11 13:30:00+00:00      0     45     45      0 ...

В настоящее время я делаю это наивно, перебираю строки и ищуЯчейки каждой строки данных, и, как вы можете себе представить, это довольно медленно.Есть ли какие-нибудь панды-фу, которые могут быть выполнены для такого типа биннинга по диапазонам даты и времени?

РЕДАКТИРОВАТЬ: мысль, которая может помочь мыслить в новом направлении.Если бы я конвертировал все свои метки времени (как в моих данных, так и в помеченных бинах) в метки времени Unix (секунды с 1 января 1970 года), то это было бы вопросом объединения / суммирования на основе целочисленных диапазонов, а не дат,Затем получилось бы количество секунд в каждой ячейке, просто разделив на 60, и я получил свои минуты в каждой ячейке.Это устраняет все опасения по поводу границ дат и т. Д.

РЕДАКТИРОВАТЬ 2: В соответствии с запросом, здесь представлен набор упрощенных выборочных данных с использованием трех разных временных интервалов.Я специально сделал один из образцов данных (второй ряд) за 2 дня.Кроме того, есть result_df, который показывает ожидаемый результат.

data_samples = [
    {'start_ts': '2019-06-10T12:00:00+0000', 'end_ts': '2019-06-10T22:30:00+0000'},
    {'start_ts': '2019-06-10T22:00:00+0000', 'end_ts': '2019-06-11T05:30:00+0000'},
    {'start_ts': '2019-06-10T10:00:00+0000', 'end_ts': '2019-06-10T14:15:00+0000'},
    {'start_ts': '2019-06-12T08:07:00+0000', 'end_ts': '2019-06-12T18:22:00+0000'},
    {'start_ts': '2019-06-11T14:03:00+0000', 'end_ts': '2019-06-11T15:30:00+0000'},
    {'start_ts': '2019-06-11T02:33:00+0000', 'end_ts': '2019-06-11T10:31:00+0000'}
]

data_set = [{
    'start_ts': datetime.datetime.strptime(x['start_ts'], '%Y-%m-%dT%H:%M:%S%z'),
    'end_ts': datetime.datetime.strptime(x['end_ts'], '%Y-%m-%dT%H:%M:%S%z')} for x in data_samples]

data_df = pd.DataFrame(data_set)[['start_ts', 'end_ts']]

time_bin_samples = [
    {'start_ts': '2019-06-10T00:00:00+0000', 'end_ts': '2019-06-10T08:15:00+0000', 'label': 't1'},
    {'start_ts': '2019-06-10T08:15:00+0000', 'end_ts': '2019-06-10T18:00:00+0000', 'label': 't2'},
    {'start_ts': '2019-06-10T18:00:00+0000', 'end_ts': '2019-06-11T00:00:00+0000', 'label': 't3'},

    {'start_ts': '2019-06-11T00:00:00+0000', 'end_ts': '2019-06-11T09:00:00+0000', 'label': 't1'},
    {'start_ts': '2019-06-11T09:00:00+0000', 'end_ts': '2019-06-11T19:15:00+0000', 'label': 't2'},
    {'start_ts': '2019-06-11T19:15:00+0000', 'end_ts': '2019-06-12T00:00:00+0000', 'label': 't3'},

    {'start_ts': '2019-06-12T00:00:00+0000', 'end_ts': '2019-06-12T10:30:00+0000', 'label': 't1'},
    {'start_ts': '2019-06-12T10:30:00+0000', 'end_ts': '2019-06-12T12:00:00+0000', 'label': 't2'},
    {'start_ts': '2019-06-12T12:00:00+0000', 'end_ts': '2019-06-13T00:00:00+0000', 'label': 't3'},
]

time_bin_set = [{
    'start_ts': datetime.datetime.strptime(x['start_ts'], '%Y-%m-%dT%H:%M:%S%z'),
    'end_ts': datetime.datetime.strptime(x['end_ts'], '%Y-%m-%dT%H:%M:%S%z'),
    'label': x['label']} for x in time_bin_samples
]

time_bin_df = pd.DataFrame(time_bin_set)[['start_ts', 'end_ts', 'label']]

result_set = [
    {'t1': 0, 't2': 360, 't3': 270},
    {'t1': 330, 't2': 0, 't3': 120},
    {'t1': 0, 't2': 255, 't3': 0},
    {'t1': 143, 't2': 90, 't3': 382},
    {'t1': 0, 't2': 87, 't3': 0},
    {'t1': 387, 't2': 91, 't3': 0}
]

result_df = pd.DataFrame(result_set)

1 Ответ

0 голосов
/ 07 июля 2019

Я знаю, что перебор строк в кадре данных не эффективен.

Здесь я бы попытался определить первый и последний бин на строку в data_df, используя merge_asof.

Затем я построил бы список подкадров данных, перебрав один раз значения данных, чтобы добавить все ячейки, соответствующие строке, и согласовать этот список.

Оттуда достаточно вычислить временной интервал для бина и использовать pivot_table, чтобы получить ожидаемый результат.

Код может быть:

# store the index as a column to make sure to keep it
data_df = data_df.rename_axis('ix').reset_index().sort_values(
    ['end_ts', 'start_ts'])
time_bin_df = time_bin_df.rename_axis('ix').reset_index().sort_values(
    ['end_ts', 'start_ts'])

# identify first and last bin per row
first = pd.merge_asof(data_df, time_bin_df, left_on='start_ts',
                      right_on='end_ts', suffixes=('', '_first'),
                      direction='forward').values
last = pd.merge_asof(data_df, time_bin_df, left_on='end_ts', right_on='start_ts',
                     suffixes=('', '_ bin')).values

# build a list of bin dataframes (one per row in data_df)
data = []
for i, val in enumerate(first):
    elt = time_bin_df[(time_bin_df['ix']>=val[3])
                      &(time_bin_df['ix']<=last[i][3])].copy()
    # compute the begin and end of the intersection of the period and the bin
    elt.loc[elt['start_ts']<val[1], 'start_ts'] = val[1]
    elt.loc[elt['end_ts']>val[2], 'end_ts'] = val[2]
    elt['ix_data'] = val[0]
    data.append(elt)

# concat everything
tmp = pd.concat(data)

# compute durations in minutes
tmp['duration'] = (tmp['end_ts'] - tmp['start_ts']).dt.total_seconds() / 60

# pivot to get the expected result
result_df = tmp.pivot_table('duration', 'ix_data', 'label', 'sum', fill_value=0
                            ).rename_axis(None).rename_axis(None, axis=1)

Это может занять некоторое время, потому что есть еще одна длинная операция для построения списка фреймов данных, но другие операции должны быть векторизованы.

...