Я получил то же самое предупреждение (сопровождаемое ошибкой). Я не использовал mysql в качестве бэкенда и rabbitmq для передачи сообщений, как вы. Я загружал данные из двух разных файлов в две разные таблицы в виде больших запросов в виде двух параллельных задач (GoogleCloudStorageToBigQueryOperator):
INFO - Subtask ... WARNING - State of this instance has been externally set to success. Taking the poison pill.
INFO - Subtask ... INFO - Sending Signals.SIGTERM to GPID 176
INFO - Subtask ... ERROR - Received SIGTERM. Terminating subprocesses.
...
ERROR - (MySQLdb._exceptions.OperationalError) (1213, 'Deadlock found when trying to get lock; try restarting transaction') [SQL: 'UPDATE task_instance SET state=%s WHERE task_instance.task_id = %s AND task_instance.dag_id = %s AND task_instance.execution_date = %s'] [parameters: ('queued', 'subdag_name_task_name', 'dag_name.subdag_name', datetime.datetime(2019, 6, 12, 11, 8, 53, 539047, tzinfo=<Timezone [UTC]>))] (Background on this error at: http://sqlalche.me/e/e3q8)
Как и у вас, ошибка возникает через несколько минут только после запуска.
Решение: Выполнение задач один за другим вместо параллельного решения решило проблему в моем случае.
В конце ошибки указан URL для более подробной информации об этой ошибке.