Azure Pipelines предполагает, что сервер всегда доступен. Лучшее, что я могу придумать, - это создать какой-то дроп на файловом ресурсе, а затем добавить задачу ручного вмешательства, чтобы приостановить конвейер и позволить вам сделать свое дело.
Нет ни агента с воздушным зазором, ни способа запуска части вашего конвейера в другой системе и импорта результатов.