Я пытался выполнить квантильную нормализацию для набора данных, для которого я нашел этот пакет microarray_quantilenorm, но он показывает ошибку при установке пакета.
Любой другой код, который может квантильно нормализовать набор данных. Не обращайте внимания на дефис и подчеркивание.
pip install microarray-quantilenorm
Сбор микрочипов-квантиленорм
Использование кэшированных https://files.pythonhosted.org/packages/3f/3b/67d0bcba2398839affb7b7abebf4e3b50c0cea2fa3a7b38e63337d34ce61/microarray_quantilenorm-0.1008.tar.gz
Требование уже выполнено: Matplotlib> = 1.4.3 в c: \ users \ akasp \ appdata \ local \ Programs \ python \ python37 \ lib \ site-packages (из микрочипа-квантиленорм) (3.0.3)
Требование уже выполнено: Scipy> = 0.15.1 в c: \ users \ akasp \ appdata \ local \ Programs \ python \ python37 \ lib \ site-packages (из микрочипа-квантиленорм) (1.2.1)
Требование уже выполнено: kiwisolver> = 1.0.1 в c: \ users \ akasp \ appdata \ local \ Programs \ python \ python37 \ lib \ site-packages (из Matplotlib> = 1.4.3-> microarray-quantilenorm) (1.1. 0)
Требование уже выполнено: python-dateutil> = 2.1 в c: \ users \ akasp \ appdata \ local \ Programs \ python \ python37 \ lib \ site-packages (из Matplotlib> = 1.4.3-> microarray-quantilenorm) (2.8. 0)
Требование уже выполнено: numpy> = 1.10.0 в c: \ users \ akasp \ appdata \ local \ Programs \ python \ python37 \ lib \ site-packages (из Matplotlib> = 1.4.3-> microarray-quantilenorm) (1.16. 3)
Требование уже выполнено: cycler> = 0.10 в c: \ users \ akasp \ appdata \ local \ Programs \ python \ python37 \ lib \ site-packages (из Matplotlib> = 1.4.3-> microarray-quantilenorm) (0.10.0)
Требование уже выполнено: pyparsing! = 2.0.4,! = 2.1.2,! = 2.1.6,> = 2.0.1 в c: \ users \ akasp \ appdata \ local \ Programs \ python \ python37 \ lib \ site- пакеты (из Matplotlib> = 1.4.3-> микрочип-квантиленорм) (2.4.0)
Требование уже выполнено: setuptools в c: \ users \ akasp \ appdata \ local \ Programs \ python \ python37 \ lib \ site-packages (из kiwisolver> = 1.0.1-> Matplotlib> = 1.4.3-> microarray-quantilenorm) (41.0.1)
Требование уже выполнено: шесть> = 1,5 в c: \ users \ akasp \ appdata \ local \ Programs \ python \ python37 \ lib \ site-packages (из python-dateutil> = 2.1-> Matplotlib> = 1.4.3-> микрочип -кантиленорм) (1.12.0)
Установка собранных пакетов: микрочип-квантиленорм
Запуск setup.py install для микрочипов-квантиленорм ... ошибка
ОШИБКА: завершить вывод команды 'c: \ users \ akasp \ appdata \ local \ Programs \ python \ python37 \ python.exe' -u -c 'import setuptools, tokenize; file =' "'" 'C: \ Users \ akasp \ AppData \ Local \ Temp \ pip-install-cua5rpfb \ microarray-quantilenorm \ setup.py' "'"'; f = getattr (tokenize, '"'" 'open' "'"' , открыть) ( файл ); code = f.read (). replace ('"'" '\ r \ n' "'"', '"'" '\ n' "'"' ); f.close (); exec (скомпилировать (код, file , '"' 'exec'" '"')) 'install --record' C: \ Users \ akasp \ AppData \ Локальный \ Temp \ pip-record-118ve84v \ install-record.txt '--single-version-внешне управляемый --compile:
ОШИБКА: запущена установка
бегущая сборка
работает build_scripts
создание сборки
создание build \ scripts-3.7
ошибка: файл 'C: \ Users \ akasp \ AppData \ Local \ Temp \ pip-install-cua5rpfb \ microarray-quantilenorm \ microarray_quantilenorm \ mq' не существует
----------------------------------------
ОШИБКА: Команда "'c: \ users \ akasp \ appdata \ local \ Programs \ python \ python37 \ python.exe' -u -c 'импортирует setuptools, токенизирует; file ='" '"' C : \ Users \ akasp \ AppData \ Local \ Temp \ pip-install-cua5rpfb \ microarray-quantilenorm \ setup.py '"'" '; f = getattr (tokenize,' "'"' open '"'" ', open ) ( file ); code = f.read (). Replace ('"'" \ r \ n '"'" ',' "'"' \ n '"'" '); f.close (); exec (скомпилировать (код, file , '"'" exec "" '"')) 'install --record' C: \ Users \ akasp \ AppData \ Local \ Temp \ pip-record-118ve84v \ install-record.txt '--single-version-внешне управляемый --compile "завершилась ошибкой с кодом ошибки 1 в C: \ Users \ akasp \ AppData \ Local \ Temp \ pip-install- cua5rpfb \ микрочипов quantilenorm \