Как масштабировать слой ggplot annotation_custom с размером устройства печати? - PullRequest
Новая
       16

Как масштабировать слой ggplot annotation_custom с размером устройства печати?

1 голос
/ 24 марта 2019

Я хотел бы построить несколько ggplots, которые имеют слои аннотаций, используя plot_grid или аналогичную функцию и сохранить относительный размер / положение слоя аннотаций при построении.Ниже приведен пример: 

# Generate scatter plot with ggplot.
library(ggplot2)
data <- data.frame(x = rnorm(1000),
                   y = rnorm(1000))
p1 <- ggplot(data, aes(x = x, y = y)) + geom_point()


# Build annotation table with gridExtra::tableGrob().
library(gridExtra)
mytable <- summary(data)
tab <- tableGrob(mytable, rows=NULL, theme=tt)

# Extract x and ylims for positioning table with ggplot_build(). 
xrange <- unlist(ggplot_build(p1)$layout$panel_params[[1]][1])
yrange <- unlist(ggplot_build(p1)$layout$panel_params[[1]][8])
xmin = min(xrange)
xmax = max(xrange)
xdelta = xmax-xmin
ymin = min(yrange)
ymax = max(yrange)
ydelta = ymax-ymin

# Add annotation table to plot.
p2 <- p1 + annotation_custom(tab, xmin = xmin-0.55*xdelta, xmax,
                                  ymin = ymin+0.55*ydelta, ymax)
p2

              <img src="https://github.com/twesleyb/StackOverflow/blob/master/Rplot02.png?raw=true" width="450">

# Generate figure with multiple plots using cowplot::plot_grid(). 
library(cowplot)
fig <- plot_grid(p2,p2,p2,p2, labels = "auto")
fig 

     <img src="https://github.com/twesleyb/StackOverflow/blob/master/Rplot01.png?raw=true" width="600">

Пожалуйста, помогите мне сохранить масштаб и положение слоя аннотации на последнем рисунке.В идеале это можно сделать в порядке моего примера: создать график с аннотацией, построить несколько графиков, но я понимаю, если это невозможно.

Редактировать.

Масштабирование устройства печатипохоже, не решает проблему. 

## Exploring changing the device size.

# I think the default device size is 7x7 inches. 
png("default_size.png",width = 7, height = 7, res = 300, units = "in")
p2
dev.off()

             <img src="https://github.com/twesleyb/StackOverflow/blob/master/default_size.png?raw=true" width="450">

# Plot2x
png("2x_size.png",width = 14, height = 14, res = 300, units = "in")
p2
dev.off()

             <img src="https://github.com/twesleyb/StackOverflow/blob/master/2x_size.png?raw=true" width="450">

# Plot3x
png("3x_size.png",width = 21, height = 21, res = 300, units = "in")
p2
dev.off()

             <img src="https://github.com/twesleyb/StackOverflow/blob/master/3x_size.png?raw=true" width="450">

1 Ответ

1 голос
/ 25 марта 2019

Использование ggsave() и определение соответствующих width и height это сработало для меня; 

library(ggplot2)
library(gridExtra)
set.seed(123) #make the result reproducible

#avoid using data as your dataframe name
mydf <- data.frame(x = rnorm(1000),
                   y = rnorm(1000))  

plt <- ggplot(mydf, aes(x = x, y = y)) + geom_point()

mytable <- summary(mydf)
mytab <- tableGrob(mytable, rows=NULL) #theme = tt? tt is not defined!

xrange <- unlist(ggplot_build(plt)$layout$panel_params[[1]][1])
yrange <- unlist(ggplot_build(plt)$layout$panel_params[[1]][8])
xmin = min(xrange)
xmax = max(xrange)
xdelta = xmax-xmin
ymin = min(yrange)
ymax = max(yrange)
ydelta = ymax-ymin

tplt <- plt + annotation_custom(tab, xmin = xmin-0.55*xdelta, xmax, 
                                     ymin = ymin+0.55*ydelta, ymax) 

mygrobs <- grid.arrange(tplt, tplt, tplt, tplt,
                        nrow = 2)

ggsave("filename.jpeg", plot = mygrobs,
       scale = 1, width = 15, height = 10, units = "in",
       dpi = 300)

<a href="https://i.stack.imgur.com/5YaNL.jpg" rel="nofollow noreferrer"><img src="https://i.stack.imgur.com/5YaNL.jpg" alt="https://i.stack.imgur.com/5YaNL.jpg" title="ScaledGraphGrid!"></a>
...