Использование основных функций SQL - все будет в порядке.
Я понятия не имею, почему вы используете эту среду, но лучше всего использовать как можно более похожую среду и DEV, QA и Production, чтобы избежать неожиданности при запуске производства.
Я думаю, что SQL 2000 использует OLEDB и SQL 2008, вы можете использовать ADO.NET провайдера, и может быть много других отличий, с которыми вы можете столкнуться. поэтому лучше всего посоветовать НЕ ДЕЛАТЬ ТАК.