Я использую функцию beta.div () в adespatial package в r, чтобы попытаться вычислить индексы LCBD, сравнивая данные сообщества микробиоты кишечника среди популяции мышей-хозяев. По умолчанию LCBD указывает уникальность каждого сообщества по сравнению со всеми остальными сообществами, но я бы хотел, чтобы мои индексы LCBD отражали уникальность сообщества по сравнению только с набором других сообществ (соседних хостов) в пределах всей совокупности мышиных хостов. Есть ли способ ограничить вычисление индивидуального / локального LCBD подмножеством диад в матрице различий?