Как добавить несколько веток в «Мои ветви» в TeamCity?
Так что я могу видеть выбранные ветви только при просмотре некоторой конфигурации.
Вы не можете сделать это вручную: это просто ветки с вашими последними коммитами.
Согласно Что нового в TeamCity 2018.2 Other Improvements:
Other Improvements
Выбор веток теперь имеет опцию «Мои ветви», отображая ветви с недавними коммитами только текущего пользователя.