Кажется, вы хотите условную агрегацию.Если это так, вы можете выразить это в MS Access как:
SELECT t1.Table_Identification_Number,
AVG(IIF(t2.Column_3 = 1, t2.Column_2, NULL)) as avg_1,
AVG(IIF(t2.Column_3 = 2, t2.Column_2, NULL)) as avg_2
FROM Table_1 as t1 JOIN
Table_2 as t2
ON t1.Table_Identification_Number = t2.Table_Identification_Number
WHERE t2.Column_3 IN (1, 2)
GROUP BY t1.Table_Identification_Number;