Итак, я понял, мне нужно было добавить новый файл и указать jest, настроенный на package.json, вот так (добавлен файл mockObject)
"setupFiles": [
"./config/jest/setupJest.js",
"./config/jest/mockObject.js"
],
тогда в самом файле есть это
global.Intercom = () => {
console.log('Intercom called')
}