В документе .Rmd я генерирую несколько связанных фигур (из списка) в блоке knitr.
При вязании в html эти фигуры переносятся правильно и все видны.
При вязании в pdf все рисунки располагаются один за другим, и видны только первые два (и половина третьего).Вот некоторый код, который воспроизводит проблему:
---
title: "Example figure wrapping problem"
output:
pdf_document:
keep_tex: true
classoption:
landscape
---
# SK-N-SH plex panel {.tabset .tabset-fade}
```{r, echo=FALSE, message=FALSE}
knitr::opts_chunk$set(fig.width=6, fig.height=9, fig.show="hold", hightligh=TRUE, warnings=TRUE, error=FALSE, cache=FALSE, echo=FALSE, dpi=100)
```
```{r}
for (ii in 1:6) {
plot(1:3, 1:3, main=ii)
}
```
Я понял, что проблема связана с генерацией файла .tex, который содержит эту строку:
\includegraphics{figure/unnamed-chunk-2-1.png}\includegraphics{figure/unnamed-chunk-2-2.png}\includegraphics{figure/unnamed-chunk-2-3.png}\includegraphics{figure/unnamed-chunk-2-4.png}\includegraphics{figure/unnamed-chunk-2-5.png}\includegraphics{figure/unnamed-chunk-2-6.png}
Добавление разрывов строкикаждые два includegraphics
решают проблемы:
\includegraphics{figure/unnamed-chunk-2-1.png}\includegraphics{figure/unnamed-chunk-2-2.png}
\includegraphics{figure/unnamed-chunk-2-3.png}\includegraphics{figure/unnamed-chunk-2-4.png}
\includegraphics{figure/unnamed-chunk-2-5.png}\includegraphics{figure/unnamed-chunk-2-6.png}
Однако это, очевидно, не практично, так как есть еще много цифр.Я мог бы также запустить sed 's/}\(\\includegraphics\)/}\r\1/g'
для файла, но это бесполезно усложняет процесс компиляции.
Есть ли собственный knitr
или rmarkdown
способ решить мою проблему.