Можете ли вы опубликовать свой файл pom? Или хотя бы соответствующие разделы? У вас должно быть что-то вроде следующего:
<build>
<pluginManagement>
<plugins>
...snip...
<!-- cobertura code coverage plugin -->
<plugin>
<groupId>org.codehaus.mojo</groupId>
<artifactId>cobertura-maven-plugin</artifactId>
<version>2.2</version>
<configuration>
<formats>
<format>xml</format>
</formats>
</configuration>
</plugin>
<!-- end cobertura code coverage plugin -->
</plugins>
</pluginManagement>
</build>
<reporting>
<plugins>
<plugin>
<groupId>org.codehaus.mojo</groupId>
<artifactId>cobertura-maven-plugin</artifactId>
<version>2.2</version>
<configuration>
<formats>
<format>xml</format>
</formats>
</configuration>
</plugin>
</plugins>
</reporting>
Кроме того, вы придерживаетесь стандартного макета каталога maven для своего источника? Где находится ваш pom-файл относительно ваших исходных файлов и как выглядит макет вашего каталога?