Вы можете добавить цикл while , чтобы пропустить пустые ячейки.Попробуйте это:
$rows = [];
for ($row = 1; $row <= $highestRow; ++$row) {
$col = 1;
$cell = $worksheet->getCellByColumnAndRow($col, $row);
// Skip empty cells
while (in_array($cell->getValue(), [null, ''], true)) {
$col++;
$cell = $worksheet->getCellByColumnAndRow($col, $row);
}
$maxCol = $col + 1;
for ( ; $col <= $maxCol; ++$col) {
$value = $worksheet->getCellByColumnAndRow($col, $row)->getValue();
$rows[$row][$col] = $value;
}
}