Если вы хотите прочитать индекс из списка condA и создать список с этим номером, список индексов элементов, которые нужно удалить, будет выглядеть так:
rm_lst = [x[0] for x in condA]
Теперь, чтобы удалить элементыиз вашего основного списка:
A = [(0, ((11), (12))), (1, ((452), (54))), (2, ((545), (757))), (3, ((42), (37)))]
A_reduced = [x[1] for x in A if x[0] not in rm_lst]
Окончательный код:
A = [(0, ((11), (12))), (1, ((452), (54))), (2, ((545), (757))), (3, ((42), (37)))]
condA = [(0, ((11), (452))), (2, ((545), (757)))]
rm_lst = [x[0] for x in condA]
A_reduced = [x[1] for x in A if x[0] not in rm_lst]
print(A_reduced)