Определение ссылки на файл данных eBird, проблема с соединением AWK в r - PullRequest
Новая
       29

Определение ссылки на файл данных eBird, проблема с соединением AWK в r

0 голосов
/ 11 июня 2019

Я использую r для извлечения подмножеств базового набора данных через AWK, и у меня возникают проблемы с определением ссылки на файл данных eBird.

Чтобы устранить эту проблему, я использую r как администратор, а в следующей системесоединения с виньеткой для auk: извлечение данных Ebird на github, например,

проверить путь к рабочему каталогу setwd("C:/Users/Owner/OneDrive/Documents/Bird_Project/"

проверить, установлен ли Cygwin auk_get_awk_path() [1] "C: / cygwin64/bin/gawk.exe"

проверить, что путь ebd задан для папки Sys.getenv() EBD_PATH C:/Users/Owner/OneDrive/Documents/Bird_Project

путь к фактическому файлу ссылки input_file<-system.file('extdata/ebd_CA_relApr-2019.txt', package ="auk")

определить путьout output_file <- "ebd_filtered_birddata.txt" ebird_data <- input_file %>%

вызов данных и фильтра auk_ebd() %>% date = c("*-03-20", "*-06-21") #spring

читает сообщение об ошибке Error in ebird_data <- input_file %>% auk_ebd() %>% date = c("*-03-20", : object 'ebird_data' not found

Пример виньетки работает.Я не могу открыть соединение с реальным файлом.Там написано

Error in file(con, "r") : cannot open the connection In addition: Warning message: In file(con, "r") : cannot open file 'C:/Users/Owner/OneDrive/Documents/Bird_Project': Permission denied >

...