pandas_profiling создает объект, который затем необходимо отобразить или вывести. Один из стандартных способов сделать это - сохранить его в формате HTML:
profile.to_file(outputfile="sample_file_name.html")
("profile" - это переменная, которую вы использовали для сохранения самого профиля)
Это не относится конкретно к ipython - разница в том, что поскольку вы идете построчно (вместо того, чтобы выполнять полный блок кода, включая этап создания отчетов), он показывает сам объект. Приведенный выше код позволит вам увидеть отчет после его открытия.