Ошибка 2: Нет такого файла или каталога: 'C: \\ tmp \\ cat.log' - PullRequest
0 голосов
/ 24 июня 2019

Я запускаю инструмент Concept Annotation Tool (CAT) с помощью Docker, а затем устанавливаю его так же, как на следующем веб-сайте: https://libraries.io/pypi/medcat Эти шаги были успешными.

Тогда я хотел реализовать это в своем коде Python. Когда я запускаю код, я получаю сообщение об ошибке из строк импорта:

Traceback (most recent call last):

  File "<ipython-input-10-32d167ab52db>", line 1, in <module>
    runfile('C:/Users/as/Desktop/Data/Preprocessing.py', wdir='C:/Users/as/Desktop/Data')

  File "C:\Users\as\AppData\Local\Continuum\anaconda3\lib\site-packages\spyder_kernels\customize\spydercustomize.py", line 786, in runfile
    execfile(filename, namespace)

  File "C:\Users\as\AppData\Local\Continuum\anaconda3\lib\site-packages\spyder_kernels\customize\spydercustomize.py", line 110, in execfile
    exec(compile(f.read(), filename, 'exec'), namespace)

  File "C:/Users/as/Desktop/Data/Preprocessing.py", line 27, in <module>
    from medcat.cat import CAT

  File "C:\Users\as\AppData\Local\Continuum\anaconda3\lib\site-packages\medcat\cat.py", line 4, in <module>
    from medcat.cdb import CDB

  File "C:\Users\as\AppData\Local\Continuum\anaconda3\lib\site-packages\medcat\cdb.py", line 9, in <module>
    from medcat.utils.loggers import basic_logger

  File "C:\Users\as\AppData\Local\Continuum\anaconda3\lib\site-packages\medcat\utils\loggers.py", line 6, in <module>
    logging.basicConfig(filename='/tmp/cat.log', level=logging.DEBUG)

  File "C:\Users\as\AppData\Local\Continuum\anaconda3\lib\logging\__init__.py", line 1900, in basicConfig
    h = FileHandler(filename, mode)

  File "C:\Users\as\AppData\Local\Continuum\anaconda3\lib\logging\__init__.py", line 1092, in __init__
    StreamHandler.__init__(self, self._open())

  File "C:\Users\as\AppData\Local\Continuum\anaconda3\lib\logging\__init__.py", line 1121, in _open
    return open(self.baseFilename, self.mode, encoding=self.encoding)

  FileNotFoundError: [Errno 2] No such file or directory: 'C:\\tmp\\cat.log'

Код, который я запускаю:

from medcat.cat import CAT
from medcat.utils.vocab import Vocab
from medcat.prepare_cdb import PrepareCDB
from medcat.cdb import CDB

vocab = Vocab()
#Load the vocab model
vocab.load_dict('C:/Users/as/Desktop/Data/med_ann_norm_dict.dat')

#build a special CDB from a .csv file
preparator = PrepareCDB(vocab=vocab)
csv_paths = ['C:/Users/as/Desktop/Data/codes.csv']
cdb = preparator.prepare_csvs(csv_paths)

#Annotate the text
doc = text
cat = CAT(cdb=cdb, vocab=vocab)

Я также попытался найти файл, поэтому искал каталог %tmp%. Поиск вернул мне каталог Temp, и нет файла с именем cat.log.

...