В новом новом проекте было бы разумно игнорировать базу данных и ничего больше.
Тогда это зависит от того, какие другие инструменты вы используете. Например, если вы используете покрытие, было бы неплохо игнорировать его файлы, и ваш .gitignore будет выглядеть так:
# SQLite
db.sqlite3
# coverage
htmlcov/**
.coverage