Как я преобразовываю свой список в этот желаемый список

Question

У меня есть данные двух столбцов, идентификатор гена первого столбца и значение выражения второго столбца

как показано ниже

6876    -2.735085846
59  -2.559180326
72  -2.41504926
4638    -1.785835164

Я хочу что-то вроде

> str(geneList)
 Named num [1:12495] 4.57 4.51 4.42 4.14 3.88 ...
 - attr(*, "names")= chr [1:12495] "4312" "8318" "10874" "55143" ...

Но когда я делаю

X = as.character(t(read.table(text ="
6876    -2.735085846
59  -2.559180326
72  -2.41504926
4638    -1.785835164")))

Я получаю

> str(X)
 chr [1:1418] "6876" "-2.735085846" "59" "-2.559180326" "72" "-2.41504926" "4638" "-1.785835164" "10398" "-1.588650179" ...
>

Как я могу сделать что-то вроде geneList?

Answer 1

Просто используйте setNames после считывания данных с read.table.

X <- read.table(text = "
6876    -2.735085846
59  -2.559180326
72  -2.41504926
4638    -1.785835164
")


geneList <- setNames(X[[2]], X[[1]])
#     6876        59        72      4638 
#-2.735086 -2.559180 -2.415049 -1.785835 

И чтобы соответствовать ожидаемому результату:

str(geneList)
# Named num [1:4] -2.74 -2.56 -2.42 -1.79
# - attr(*, "names")= chr [1:4] "6876" "59" "72" "4638"