Установка CERN ROOT на Google Jupyter Notebook - PullRequest
Новая
       47

Установка CERN ROOT на Google Jupyter Notebook

0 голосов
/ 06 апреля 2019

Я попытался установить CERN ROOT http://root.cern.ch в коллаборации Google. Ноутбук Jupiter https://colab.research.google.com. Не удается запустить Python с ROOT, он вылетает по адресу: import ROOT

IУстанавливали ROOT как обычно: 

!mkdir -p APPS
!pwd
!cd APPS && wget https://root.cern/download/root_v6.16.00.Linux-ubuntu18-x86_64-gcc7.3.tar.gz 
!cd APPS && tar -xf root_v6.16.00.Linux-ubuntu18-x86_64-gcc7.3.tar.gz

!ls APPS/root/bin/thisroot.sh
!source APPS/root/bin/thisroot.sh
!echo $ROOTSYS
!echo $PYTHONPATH

import ROOT

Скрипт APPS / root / bin / thisroot.sh должен определять переменные PYTHONPATH и ROOTSYS, поэтому это должно позволить использовать ROOT из python.

ПРОБЛЕМА: После запуска этого сценария переменные окружения не устанавливаются, поэтому я не могу запустить ROOT с моим питоном.

Итак, как настроить эти переменные ????

Спасибо, Марцин

1 Ответ

0 голосов
/ 17 апреля 2019

Я также попытался использовать ROOT в записной книжке Google Colab Laboratory Jupiter и обнаружил, что некоторые библиотеки должны быть загружены перед импортом ROOT.Следующий код работает по крайней мере в моей записной книжке. 

!mkdir -p APPS
!pwd
!cd APPS && wget https://root.cern.ch/download/root_v6.13.08.Linux-ubuntu18-x86_64-gcc7.3.tar.gz 
!cd APPS && tar -xf root_v6.13.08.Linux-ubuntu18-x86_64-gcc7.3.tar.gz

import sys
sys.path.append("/content/APPS/root/lib")
import ctypes
ctypes.cdll.LoadLibrary('/content/APPS/root/lib/libCore.so')
ctypes.cdll.LoadLibrary('/content/APPS/root/lib/libThread.so')
ctypes.cdll.LoadLibrary('/content/APPS/root/lib/libImt.so')
ctypes.cdll.LoadLibrary('/content/APPS/root/lib/libRIO.so')
ctypes.cdll.LoadLibrary('/content/APPS/root/lib/libNet.so')
ctypes.cdll.LoadLibrary('/content/APPS/root/lib/libTree.so')
ctypes.cdll.LoadLibrary('/content/APPS/root/lib/libMathCore.so')
ctypes.cdll.LoadLibrary('/content/APPS/root/lib/libMatrix.so')
ctypes.cdll.LoadLibrary('/content/APPS/root/lib/libHist.so')
ctypes.cdll.LoadLibrary('/content/APPS/root/lib/libGraf.so')
import ROOT

h = ROOT.TH1F("gauss","Example histogram",100,-4,4)
h.FillRandom("gaus")
c = ROOT.TCanvas("myCanvasName","The Canvas Title",800,600)
h.Draw()
c.Draw()

Если вы используете ROOT v6.16.00, вы увидите ошибку, как показано ниже. 

OSError: /content/APPS/root/lib/libImt.so: undefined symbol: _ZN3tbb10interface78internal20isolate_within_arenaERNS1_13delegate_baseEl

Кстати,версии Ubuntu, gcc и python из коллаборации Google перечислены ниже. 

Ubuntu 18.04.2 LTS (Bionic Beaver)
gcc version 7.3.0 (Ubuntu 7.3.0-27ubuntu1~18.04) 
python 2.7.15rc1 (default, Nov 12 2018, 14:31:15)
...