Welp, это потому, что я включил буферизацию вывода .Из документации Apache:
Обязательно отключите буферизацию в своей программе.
Выключил и теперь он работает.
Обновление
Это, по-видимому, не решило проблему.Не уверен, почему это сработало, а сейчас нет.Если у кого-то есть какие-либо предложения, я их приму.
Обновление 2
Хорошо, на этот раз я удалил косую черту, и похоже, что она работает:
RewriteRule ^.*$ http://exampledomain.com/%{ENV:MAPTO}/$0 [P,NC]
Я предполагаю, что если входящий домен не имел каталогов или имен файлов, он закрывался двойной косой чертой, и это вызывало перенаправление страницы.