Сначала добавьте файл / папку в файл .gitignore (уровень проекта)
Перейдите в терминал в Android Studio и введите следующие команды:
git rm -r the-directory-to-remove
Приведенная выше команда удалит указанный каталог из git.
git commit -m "Delete .idea folder"
Приведенная выше команда фиксирует изменения, вы можете изменить «Удалить папку .idea» на любую, какую захотите.
git push origin <your-git-branch>
Приведенная выше команда переносит изменения в Github (или BitBucket).
Теперь, если вы хотите удалить файл только из Github / BitBucket, ноне для всей файловой системы, введите git rm -r --cached myFolder вместо первой команды.