Как я преобразовываю символы в двоичные значения в R - PullRequest
0 голосов
/ 11 июня 2019

У меня есть фрейм данных с * и - я хочу конвертировать * в 1 и - в 0, но я не знаю, что делать

Это мой фрейм данных

> head(Patient_036)
       Driver SNV_Organoid_036 INDEL_Organoid_036 Deletion_Organoid_036
ABCB1       *                -                  *                     -
ACVR1B      *                *                  *                     -
ACVR2A      *                *                  -                     -
APC         *                -                  *                     -
ARID1A      *                -                  *                     -
ARID1B      *                *                  -                     -

Любая помощь, пожалуйста?

1 Ответ

0 голосов
/ 11 июня 2019
Patient_036[Patient_036 == "*"] <- 1
Patient_036[Patient_036 == "-"] <- 0

DATA:

Patient_036 <- structure(list(Driver = c("1", "1", "1", "1", "1", "1"), SNV_Organoid_036 = c("0", 
"1", "1", "0", "0", "1"), INDEL_Organoid_036 = c("1", "1", "0", 
"1", "1", "0"), Deletion_Organoid_036 = c("0", "0", "0", "0", 
"0", "0")), row.names = c("ABCB1", "ACVR1B", "ACVR2A", "APC", 
"ARID1A", "ARID1B"), class = "data.frame")

Если ваш фрейм данных содержит factors, сначала вам может понадобиться df[] <- lapply(df, as.character). В этом нет необходимости, если вы добавите stringsAsFactors = FALSE или что-то эквивалентное при чтении данных.

...