Проверьте имена скриптов в файле package.json, они могут называться как-то иначе для запуска.например, эта часть:
"scripts": {
"build": "cd packages/react-scripts && node bin/react-scripts.js build",
"start": "cd packages/react-scripts && node bin/react-scripts.js start",
},
Кроме того, попробуйте распечатать свой рабочий каталог, используя pwd, и проверьте, является ли текущий каталог правильным, и снова запустите npm run start.