У меня есть файл CSV ниже.Я хотел бы иметь возможность преобразовать его, чтобы у меня были идентификаторы без URL-адресов.
tID,type,usageID,Usage,status,tStatus,proParte,sName,snID,canName,scAuth,pnuID,tRank,trSort,King,class,subclass,family,created,modified,datasetName,tcID,Ref,refID,tRemarks,tDist,hClass,fhpName,fhpnID,shpn,shpnID,nomCode,Lic,ccaID
https://some-url.com/tree/90000607/90000610,scientific,https://some-url.com/tree/90000607/90000610,Bacteria,,accepted,f,Bacteria,https://some-url.com/name/bbni/90000608,Bacteria,,,Regnum,10,Bacteria,,,,2018-12-06 14:48:14.395+11,2018-12-06 14:48:14.708+11,BBC,https://some-url.com/instance/bbni/90000609,TWD,https://some-url.com/reference/bbni/90000596,,,Bacteria,,,,,ABC,-,/tree/90000607/90000610
Я хотел бы добиться одного из двух следующих результатов.Я пробовал разные вещи, используя sed piping несколько раз, но я не могу сделать это одной командой, используя regEx.
Опция 1:
tID,type,usageID,Usage,status,tStatus,proParte,sName,snID,canName,scAuth,pnuID,tRank,trSort,King,class,subclass,family,created,modified,datasetName,tcID,Ref,refID,tRemarks,tDist,hClass,fhpName,fhpnID,shpn,shpnID,nomCode,Lic,ccaID
tree/90000607/90000610,scientific,tree/90000607/90000610,Bacteria,,accepted,f,Bacteria,name/bbni/90000608,Bacteria,,,Regnum,10,Bacteria,,,,2018-12-06 14:48:14.395+11,2018-12-06 14:48:14.708+11,BBC,instance/bbni/90000609,TWD,reference/bbni/90000596,,,Bacteria,,,,,ABC,-,/tree/90000607/90000610
Вариант 2:
tID,type,usageID,Usage,status,tStatus,proParte,sName,snID,canName,scAuth,pnuID,tRank,trSort,King,class,subclass,family,created,modified,datasetName,tcID,Ref,refID,tRemarks,tDist,hClass,fhpName,fhpnID,shpn,shpnID,nomCode,Lic,ccaID
90000610,scientific,90000610,Bacteria,,accepted,f,Bacteria,90000608,Bacteria,,,Regnum,10,Bacteria,,,,2018-12-06 14:48:14.395+11,2018-12-06 14:48:14.708+11,BBC,90000609,TWD,90000596,,,Bacteria,,,,,ABC,-,90000610
Если кто-то может помочь с тем, что вы сделали раньше, это поможет мне.
Вещи, которые я попробовал:
#!/bin/bash
sed -e 's/[a-z]*:\/\/[a-z]*.[a-z]*.[a-z]*\/[a-z]*\/[a-z]*\/[a-z]*\/[a-z]*//g' BBC-taxon-2019-03-26-4546.csv > test.csv
sed -e 's/[0-9]\/[0-9]/[0-9]|[0-9]/g' test.csv
Над кодом необходимо написать команду для каждого типа замены и каждый раз создавать новый файл, поэтому я отказался.
#!/bin/bash
# Set Input File here...
input="BBC-taxon-2019-03-26-4546.csv"
# Check if file exists
[ ! -f $input ] && { echo "No file with name: $input. File not found"; exit 123; }
# Set file separator and read fields into variables
while IFS=',' read -ra fields;
do
echo "Fields: ${fields[*]}"
echo "Number of Elements: ${#fields[@]}"
echo "Each Element has: ${#fields}"
for i in "${fields[@]}"
do
echo $i
done
# fields[0] = ${fields[0]}
done < "$input"
Приведенный выше код создает итеративный массив, но я не знаю, как использовать sed в каждой ячейке значения для определенного столбца.Если кто-то может помочь, это здорово.