Невозможно создать графические ссылки / ребра, используя networkx и d3 - PullRequest
Новая
       18

Невозможно создать графические ссылки / ребра, используя networkx и d3

0 голосов
/ 09 июля 2019

Я пытаюсь создать простой граф узлов и ребер из вызова API остальных ... Пока что я могу получить узлы, вывести его как json и отправить в d3 для визуализации. Проблема в том, что я не могу построить грани или ссылки. Это дает мне ошибку ниже 

e = (link['link']['destination']['node']['node-id'], link['link']['source']['node']['node-id'])
TypeError: 'int' object has no attribute '__getitem__'

Это детали вызова узлов и ссылок из ODL REST API 

Nodes List:
Node ID -  openflow:1
Node ID -  host:00:00:00:00:00:01
Node ID -  openflow:2
Node ID -  host:00:00:00:00:00:02

Links List:
Link ID -  host:00:00:00:00:00:01/openflow:1:1
Link ID -  openflow:2:1/host:00:00:00:00:00:02
Link ID -  openflow:1:2
Link ID -  openflow:2:2
Link ID -  openflow:1:1/host:00:00:00:00:00:01
Link ID -  host:00:00:00:00:00:02/openflow:2:1

Это информационный звонок от API 

{
  u'network-topology': {
    u'topology': [
      {
        u'node': [
          {
            u'opendaylight-topology-inventory:inventory-node-ref': u"/opendaylight-inventory:nodes/opendaylight-inventory:node[opendaylight-inventory:id='openflow:1']",
            u'node-id': u'openflow:1',
            u'termination-point': [
              {
                u'opendaylight-topology-inventory:inventory-node-connector-ref': u"/opendaylight-inventory:nodes/opendaylight-inventory:node[opendaylight-inventory:id='openflow:1']/opendaylight-inventory:node-connector[opendaylight-inventory:id='openflow:1:2']",
                u'tp-id': u'openflow:1:2'
              },
              {
                u'opendaylight-topology-inventory:inventory-node-connector-ref': u"/opendaylight-inventory:nodes/opendaylight-inventory:node[opendaylight-inventory:id='openflow:1']/opendaylight-inventory:node-connector[opendaylight-inventory:id='openflow:1:1']",
                u'tp-id': u'openflow:1:1'
              },
              {
                u'opendaylight-topology-inventory:inventory-node-connector-ref': u"/opendaylight-inventory:nodes/opendaylight-inventory:node[opendaylight-inventory:id='openflow:1']/opendaylight-inventory:node-connector[opendaylight-inventory:id='openflow:1:LOCAL']",
                u'tp-id': u'openflow:1:LOCAL'
              }
            ]
          },
          {
            u'host-tracker-service:addresses': [
              {
                u'first-seen': 1562655393902,
                u'ip': u'10.0.0.1',
                u'mac': u'00:00:00:00:00:01',
                u'id': 6,
                u'last-seen': 1562655393902
              }
            ],
            u'host-tracker-service:id': u'00:00:00:00:00:01',
            u'host-tracker-service:attachment-points': [
              {
                u'active': True,
                u'corresponding-tp': u'host:00:00:00:00:00:01',
                u'tp-id': u'openflow:1:1'
              }
            ],
            u'node-id': u'host:00:00:00:00:00:01',
            u'termination-point': [
              {
                u'tp-id': u'host:00:00:00:00:00:01'
              }
            ]
          },
          {
            u'opendaylight-topology-inventory:inventory-node-ref': u"/opendaylight-inventory:nodes/opendaylight-inventory:node[opendaylight-inventory:id='openflow:2']",
            u'node-id': u'openflow:2',
            u'termination-point': [
              {
                u'opendaylight-topology-inventory:inventory-node-connector-ref': u"/opendaylight-inventory:nodes/opendaylight-inventory:node[opendaylight-inventory:id='openflow:2']/opendaylight-inventory:node-connector[opendaylight-inventory:id='openflow:2:LOCAL']",
                u'tp-id': u'openflow:2:LOCAL'
              },
              {
                u'opendaylight-topology-inventory:inventory-node-connector-ref': u"/opendaylight-inventory:nodes/opendaylight-inventory:node[opendaylight-inventory:id='openflow:2']/opendaylight-inventory:node-connector[opendaylight-inventory:id='openflow:2:1']",
                u'tp-id': u'openflow:2:1'
              },
              {
                u'opendaylight-topology-inventory:inventory-node-connector-ref': u"/opendaylight-inventory:nodes/opendaylight-inventory:node[opendaylight-inventory:id='openflow:2']/opendaylight-inventory:node-connector[opendaylight-inventory:id='openflow:2:2']",
                u'tp-id': u'openflow:2:2'
              }
            ]
          },
          {
            u'host-tracker-service:addresses': [
              {
                u'first-seen': 1562655393906,
                u'ip': u'10.0.0.2',
                u'mac': u'00:00:00:00:00:02',
                u'id': 7,
                u'last-seen': 1562655393906
              }
            ],
            u'host-tracker-service:id': u'00:00:00:00:00:02',
            u'host-tracker-service:attachment-points': [
              {
                u'active': True,
                u'corresponding-tp': u'host:00:00:00:00:00:02',
                u'tp-id': u'openflow:2:1'
              }
            ],
            u'node-id': u'host:00:00:00:00:00:02',
            u'termination-point': [
              {
                u'tp-id': u'host:00:00:00:00:00:02'
              }
            ]
          }
        ],
        u'link': [
          {
            u'link-id': u'host:00:00:00:00:00:01/openflow:1:1',
            u'destination': {
              u'dest-node': u'openflow:1',
              u'dest-tp': u'openflow:1:1'
            },
            u'source': {
              u'source-tp': u'host:00:00:00:00:00:01',
              u'source-node': u'host:00:00:00:00:00:01'
            }
          },
          {
            u'link-id': u'openflow:2:1/host:00:00:00:00:00:02',
            u'destination': {
              u'dest-node': u'host:00:00:00:00:00:02',
              u'dest-tp': u'host:00:00:00:00:00:02'
            },
            u'source': {
              u'source-tp': u'openflow:2:1',
              u'source-node': u'openflow:2'
            }
          },
          {
            u'link-id': u'openflow:1:2',
            u'destination': {
              u'dest-node': u'openflow:2',
              u'dest-tp': u'openflow:2:2'
            },
            u'source': {
              u'source-tp': u'openflow:1:2',
              u'source-node': u'openflow:1'
            }
          },
          {
            u'link-id': u'openflow:2:2',
            u'destination': {
              u'dest-node': u'openflow:1',
              u'dest-tp': u'openflow:1:2'
            },
            u'source': {
              u'source-tp': u'openflow:2:2',
              u'source-node': u'openflow:2'
            }
          },
          {
            u'link-id': u'openflow:1:1/host:00:00:00:00:00:01',
            u'destination': {
              u'dest-node': u'host:00:00:00:00:00:01',
              u'dest-tp': u'host:00:00:00:00:00:01'
            },
            u'source': {
              u'source-tp': u'openflow:1:1',
              u'source-node': u'openflow:1'
            }
          },
          {
            u'link-id': u'host:00:00:00:00:00:02/openflow:2:1',
            u'destination': {
              u'dest-node': u'openflow:2',
              u'dest-tp': u'openflow:2:1'
            },
            u'source': {
              u'source-tp': u'host:00:00:00:00:00:02',
              u'source-node': u'host:00:00:00:00:00:02'
            }
          }
        ],
        u'topology-id': u'flow:1'
      }
    ]
  }
}

Это код, с которым я тестирую, где он может получить только узлы, но не ссылки / ребра ... 

# get nodes
resp, content = h.request(url, "GET")
nodeData = json.loads(content)
topology = nodeData['network-topology']['topology'][0]
print "Nodes List:"
for i in range(len(topology['node'])):
    print "Node ID - ", topology['node'][i]['node-id']
    i += 1

# Get links/edges
resp, content = h.request(url, "GET")
linkData = json.loads(content)
topology = linkData['network-topology']['topology'][0]
print "Links List:"
for i in range(len(topology['link'])):
    print "Link ID - ", topology['link'][i]['link-id']
    i += 1


# Add nodes and links into graph
graph = nx.Graph()
for node in range(len(topology['node'])):
    graph.add_node(topology['node'][node]['node-id'])
for link in range(len(topology['link'])):
    e = (link['link']['destination']['node']['node-id'], link['link']['source']['node']['node-id'])
    graph.add_edge(*e)


print "Graph Nodes:"
print graph.nodes()
print "Graph Links:"
print graph.links()

# write json formatted data to use in visualization
d = json_graph.node_link_data(graph)
json.dump(d, open('topo.json','w'))
print('Wrote node-link JSON data')

Я попытался удалить коды, связанные со ссылкой / ребром, и остаться узлом, и никаких проблем ... Я могу получить подробную информацию об узлах в topo.json ... но когда я добавляю граф для ссылок, у меня возникает проблема

Проблема здесь в том, что я не могу отобразить ребра или ссылки. Это дает мне ошибку ниже 

e = (link['link']['destination']['node']['node-id'], link['link']['source']['node']['node-id'])
TypeError: 'int' object has no attribute '__getitem__'

Я просто не знаю, как решить эту проблему ... ценим советы и помощь экспертов здесь .. Спасибо

@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@ @

Я изменил ниже, но получил другую ошибку TypeError: строковые индексы должны быть целыми числами 

# Get links/edges
resp, content = h.request(url, "GET")
linkData = json.loads(content)
a = linkData['network-topology']['topology'][0]
print a

# Add links into graph
graph = nx.Graph()
for link in a:
    e = (link['link']['destination']['node']['node-id'], link['link']['source']['node']['node-id'])
    graph.add_edge(*e)

распечатать выше дать вывод ниже 

{
  u'node': [
    {
      u'opendaylight-topology-inventory:inventory-node-ref': u"/opendaylight-inventory:nodes/opendaylight-inventory:node[opendaylight-inventory:id='openflow:1']",
      u'node-id': u'openflow:1',
      u'termination-point': [
        {
          u'opendaylight-topology-inventory:inventory-node-connector-ref': u"/opendaylight-inventory:nodes/opendaylight-inventory:node[opendaylight-inventory:id='openflow:1']/opendaylight-inventory:node-connector[opendaylight-inventory:id='openflow:1:2']",
          u'tp-id': u'openflow:1:2'
        },
        {
          u'opendaylight-topology-inventory:inventory-node-connector-ref': u"/opendaylight-inventory:nodes/opendaylight-inventory:node[opendaylight-inventory:id='openflow:1']/opendaylight-inventory:node-connector[opendaylight-inventory:id='openflow:1:1']",
          u'tp-id': u'openflow:1:1'
        },
        {
          u'opendaylight-topology-inventory:inventory-node-connector-ref': u"/opendaylight-inventory:nodes/opendaylight-inventory:node[opendaylight-inventory:id='openflow:1']/opendaylight-inventory:node-connector[opendaylight-inventory:id='openflow:1:LOCAL']",
          u'tp-id': u'openflow:1:LOCAL'
        }
      ]
    },
    {
      u'host-tracker-service:addresses': [
        {
          u'first-seen': 1562655393902,
          u'ip': u'10.0.0.1',
          u'mac': u'00:00:00:00:00:01',
          u'id': 6,
          u'last-seen': 1562655393902
        }
      ],
      u'host-tracker-service:id': u'00:00:00:00:00:01',
      u'host-tracker-service:attachment-points': [
        {
          u'active': True,
          u'corresponding-tp': u'host:00:00:00:00:00:01',
          u'tp-id': u'openflow:1:1'
        }
      ],
      u'node-id': u'host:00:00:00:00:00:01',
      u'termination-point': [
        {
          u'tp-id': u'host:00:00:00:00:00:01'
        }
      ]
    },
    {
      u'opendaylight-topology-inventory:inventory-node-ref': u"/opendaylight-inventory:nodes/opendaylight-inventory:node[opendaylight-inventory:id='openflow:2']",
      u'node-id': u'openflow:2',
      u'termination-point': [
        {
          u'opendaylight-topology-inventory:inventory-node-connector-ref': u"/opendaylight-inventory:nodes/opendaylight-inventory:node[opendaylight-inventory:id='openflow:2']/opendaylight-inventory:node-connector[opendaylight-inventory:id='openflow:2:LOCAL']",
          u'tp-id': u'openflow:2:LOCAL'
        },
        {
          u'opendaylight-topology-inventory:inventory-node-connector-ref': u"/opendaylight-inventory:nodes/opendaylight-inventory:node[opendaylight-inventory:id='openflow:2']/opendaylight-inventory:node-connector[opendaylight-inventory:id='openflow:2:1']",
          u'tp-id': u'openflow:2:1'
        },
        {
          u'opendaylight-topology-inventory:inventory-node-connector-ref': u"/opendaylight-inventory:nodes/opendaylight-inventory:node[opendaylight-inventory:id='openflow:2']/opendaylight-inventory:node-connector[opendaylight-inventory:id='openflow:2:2']",
          u'tp-id': u'openflow:2:2'
        }
      ]
    },
    {
      u'host-tracker-service:addresses': [
        {
          u'first-seen': 1562655393906,
          u'ip': u'10.0.0.2',
          u'mac': u'00:00:00:00:00:02',
          u'id': 7,
          u'last-seen': 1562655393906
        }
      ],
      u'host-tracker-service:id': u'00:00:00:00:00:02',
      u'host-tracker-service:attachment-points': [
        {
          u'active': True,
          u'corresponding-tp': u'host:00:00:00:00:00:02',
          u'tp-id': u'openflow:2:1'
        }
      ],
      u'node-id': u'host:00:00:00:00:00:02',
      u'termination-point': [
        {
          u'tp-id': u'host:00:00:00:00:00:02'
        }
      ]
    }
  ],
  u'link': [
    {
      u'link-id': u'host:00:00:00:00:00:01/openflow:1:1',
      u'destination': {
        u'dest-node': u'openflow:1',
        u'dest-tp': u'openflow:1:1'
      },
      u'source': {
        u'source-tp': u'host:00:00:00:00:00:01',
        u'source-node': u'host:00:00:00:00:00:01'
      }
    },
    {
      u'link-id': u'openflow:2:1/host:00:00:00:00:00:02',
      u'destination': {
        u'dest-node': u'host:00:00:00:00:00:02',
        u'dest-tp': u'host:00:00:00:00:00:02'
      },
      u'source': {
        u'source-tp': u'openflow:2:1',
        u'source-node': u'openflow:2'
      }
    },
    {
      u'link-id': u'openflow:1:2',
      u'destination': {
        u'dest-node': u'openflow:2',
        u'dest-tp': u'openflow:2:2'
      },
      u'source': {
        u'source-tp': u'openflow:1:2',
        u'source-node': u'openflow:1'
      }
    },
    {
      u'link-id': u'openflow:2:2',
      u'destination': {
        u'dest-node': u'openflow:1',
        u'dest-tp': u'openflow:1:2'
      },
      u'source': {
        u'source-tp': u'openflow:2:2',
        u'source-node': u'openflow:2'
      }
    },
    {
      u'link-id': u'openflow:1:1/host:00:00:00:00:00:01',
      u'destination': {
        u'dest-node': u'host:00:00:00:00:00:01',
        u'dest-tp': u'host:00:00:00:00:00:01'
      },
      u'source': {
        u'source-tp': u'openflow:1:1',
        u'source-node': u'openflow:1'
      }
    },
    {
      u'link-id': u'host:00:00:00:00:00:02/openflow:2:1',
      u'destination': {
        u'dest-node': u'openflow:2',
        u'dest-tp': u'openflow:2:1'
      },
      u'source': {
        u'source-tp': u'host:00:00:00:00:00:02',
        u'source-node': u'host:00:00:00:00:00:02'
      }
    }
  ],
  u'topology-id': u'flow:1'
}

Все еще пытаюсь ее решить ... пока не повезло ...

Необходимо получить все узлы и ссылки (исходный и целевой) из вызова API, сохранить их в файле json и отправить в d3.js для визуализации графа. Пожалуйста, порекомендуйте. Спасибо

1 Ответ

0 голосов
/ 09 июля 2019

Это для цикла: 

for link in range(len(topology['link'])):
    e = (link['link']['destination']['node']['node-id'], link['link']['source']['node']['node-id'])
    graph.add_edge(*e)

говорит Python присваивать link значения 0, 1, 2, ... вплоть до длины topology['link'] (ну, длина минус 1). Это объясняет ошибку в первой строке цикла for при первом прохождении, когда он пытается найти запись ['link'] в целом числе 0. Целые числа не имеют таких записей.

Вы хотите сделать for link in topology['link']: или что-то еще? Похоже, вы ожидаете, что link будет диктовать какой-то форме.

Есть и другие проблемы с вашим кодом. 

for i in range(len(topology['link'])):
    print "Link ID - ", topology['link'][i]['link-id']
    i += 1

i+=1 не имеет особого смысла в конце блока, потому что в следующий раз, когда он повторяется, i получает новое значение из цикла for. Мне также интересно, есть ли в вашем цикле for скрытая ошибка над topology['node'], аналогичная той, которая в цикле выдает ошибку.

Добро пожаловать на сайт PullRequest, где вы можете задавать вопросы и получать ответы от других членов сообщества.

Похожие темы

...