Я разобрался в своей проблеме. Мне пришлось открыть настройки сетевого подключения в Eclipse и изменить «Active Provider» на ручной, а не на родной. Я должен был сделать это, потому что мой визуальный svn-сервер не позволял мне подключаться к нему через прокси-сервер, а native использовал прокси-сервер.
(также я проверил это при запуске, но по какой-то причине он не показывал мой прокси-сервер в диалоговом окне сетевого подключения eclipse)