Ну, вы можете создать переменную, которая будет служить флагом для открытия всплывающего окна, что-то вроде этого:
session_start();
$openPopup = (!isset($_SESSION['templateid'])) ? true : false;
затем используйте значение $openPopup
, чтобы проверить, открывать ли всплывающее окно в вашем скрипте или нет:
<script>
$(function() {
var openPopup = <?php echo $openPopup ?>;
if(openPopup) {
//open popup here
}
});
</script>