Вы можете использовать jar только в качестве сторонних библиотек, на которые есть ссылки в проекте.
(Проект-> Свойства-> Путь сборки Java-> Библиотеки-> Добавить внешние JAR-файлы)
С другой стороны, вы можете ссылаться на проект библиотеки в проекте приложения, если они находятся в одной рабочей области.
(Проект-> Свойства-> Путь сборки Java-> Проекты-> Добавить ...)