Не уверен, что это актуально, но ваша команда запускает сайт дважды, сайт mvn создаст сайт, а site: stage также запустит сайт, возможно, это вызывает проблемы, но я, честно говоря, не понимаю, почему.
Глядя на документацию JXR , в ней упоминается только сайт: цель сайта, я не могу понять, почему он не будет работать должным образом для сайта: цель этапа при его расширении. Если вы запустите цель site , скопируйте вывод в другой каталог, запустите цель site: stage и сравните вывод, который может дать некоторое представление о проблеме.
Обновление: я попробовал это сам, и внешняя ссылка была включена и красиво сгруппирована в c: \ test \ stage с правильно управляемыми перекрестными ссылками. Я включил конфигурацию, которую я использовал.
В моем родительском ПОМ я определил конфигурацию сайта следующим образом:
<build>
<plugins>
<plugin>
<artifactId>maven-site-plugin</artifactId>
<executions>
<execution>
<phase>prepare-package</phase>
<goals>
<goal>stage</goal>
</goals>
</execution>
</executions>
<configuration>
<stagingDirectory>c:\test\stage</stagingDirectory>
</configuration>
</plugin>
</plugins>
</build>
Раздел distributionManagement был настроен с информацией о сайте (на самом деле это не нужно, так как я установил директорию stagingDirectory выше, но цель не будет работать без нее).
<distributionManagement>
<site>
<id>mojo.website</id>
<name>Mojo Website</name>
<url>scp://test/</url>
</site>
</distributionManagement>
Моя конфигурация JXR в родительском pom была следующей:
<plugin>
<groupId>org.apache.maven.plugins</groupId>
<artifactId>maven-jxr-plugin</artifactId>
<reportSets>
<reportSet>
<id>src-xref</id>
<reports>
<report>jxr</report>
</reports>
</reportSet>
<reportSet>
<id>test-xref</id>
<reports>
<report>test-jxr</report>
</reports>
</reportSet>
</reportSets>
<configuration>
<aggregate>true</aggregate>
</configuration>
</plugin>
Выполнение командной строки: mvn clean site: stage
Редактировать: В комментариях есть плагин codehaus jxr с немного другой семантикой. Обязательно используйте версию org.apache.maven.plugins, а не версию org.codehaus.mojo.