Если ваша единственная проблема не в том, чтобы использовать собственный JS. У меня есть простое решение.
1. Запишите свой js-код в отдельный файл.
2. Загрузите файл в корневую папку.
3. Найдите и откройте файл header.php и вставьте путь к файлу js, убедитесь, что он находится внутри вашего раздела head. Как то так
<script src="../path/to/your/file.js"></script>
</head>
Примечание: header.php можно найти на панели инструментов wp-admin -> Внешний вид -> Редактор