Spring Boot использует snakeyaml 1.23.
Из описания это YAML 1.1
<description>YAML 1.1 parser and emitter for Java</description>
Поскольку YAML поддерживается snakeyaml-engine, а не в snakeyaml, API не совместим, поэтому вы не сможете использовать его в Spring Boot