Вы можете найти здесь очень полезную технику для определения IE с помощью условных тегов.
<!DOCTYPE your favorite doc type>
<html>
<head>...</head>
<body>
<!--[if IE]>
<div id="IEroot">
<![endif]-->
<p id="IE">This browser is IE.</p>
<p id="notIE">This browser is not IE.</p>
<!--[if IE]>
</div>
<![endif]-->
</body>
</html>
Вы можете использовать его и поместить тег script между ними, чтобы определить действие Javascript только для IE.