Вы можете скопировать каталог в извлеченную копию репозитория, затем щелкнуть правой кнопкой мыши файл, перейти к TortoiseSVN и выбрать «Добавить». Это добавит папку в репозиторий, затем передаст изменения (щелкните правой кнопкой мыши и выберите SVN Commit), и все будет хорошо.
Если этого недостаточно для вашего вопроса, я прошу прощения.
GotAmye,
Пока на удаленном сервере находится хранилище Subversion, это должно работать. Что работает на удаленном сервере, что заставляет вас думать, что возникнет проблема?