Случайно "сохранен как" .py файл и по ошибке заменил основной программный файл новым. У вас нет возможности извлечь основную программу в spyder?
( сопровождающий Spyder здесь ) Мне очень жаль, но если вы не используете программу контроля версий для своего кода (например, git или mercurial), нет способа восстановить ваш предыдущий код в Spyder.