Полагаю, что встроенный диалог confirm() в хорошем состоянии и имеет удобство использования и доступность по сравнению с пользовательскими решениями. Это также легче реализовать. Поэтому я склонен советовать людям использовать его.
Однако я заметил, что большинство "профессиональных" сайтов используют какой-то собственный механизм. Есть ли веские аргументы против confirm()?