Получает ли зафиксирован файл webpack.config.js [?]
Да, вы должны фиксировать ваши файлы конфигурации сборки, чтобы другие могли создавать ваш проект, используя их, включая файлы конфигурации веб-пакета.
или это генерируется при установке npm?
npm не имеет ничего общего с генерацией конфигурации webpack.Запуск npm install установит ваши npm-зависимости, как определено в package.json.Вы должны добавить webpack в качестве зависимости к package.json, запустив npm install webpack --dev.
Запуск npm install может установить зависимость, которая имеет webpack.config.js, но это не будет генерируется как таковой.Папка node_modules должна находиться в вашем файле .gitignore, поэтому вам не нужно беспокоиться о случайной фиксации файлов в node_modules.